2014. gada decembrī divi pētījumi par salīdzinošo HIV vīrusu izplatību Dienvidāfrikā un Eiropā attiecīgi izteica divus ļoti atšķirīgus secinājumus.
Pirmais, kas tika veikts Botsvānā un Dienvidāfrikā, liecināja, ka vīrusa pielāgošana dažām HIV rezistentu gēnu šķirnēm, ko sauc par cilvēka leikocītu antigēnu B (HLA-B), efektīvi mazina vīrusa spēju pavairot, tādējādi lēnāk slimības progresēšana .
Otrais, kas vairākus gadus sekoja Eiropas pacientu grupai, īpaši aplūkojās vidējā vīrusa slodze un CD4 skaits tikai pēc akūtas infekcijas stadijas, un secināja, ka tikai ar slimības progresēšanu HIV ir kļuvis daudz virulents ātrāk slimības progresēšana.
Kā ir iespējams, ka divi pētījumi beidzās ar šādām pārsteidzoši atšķirīgām interpretācijām? Vai tas ir vienkārši apšaubāma pētījuma dizaina gadījums vai ir iespējams, ka vīrusa mainīgums no kontinenta uz kontinentu vai pat no valsts uz otru – ir noveda pie zinātnieku komandām pilnīgi pretējā virzienā?
Mērīšana HIV virulence Botsvānā un Dienvidāfrikā.
Pirmajā pētījumā Oksfordas Universitātes zinātnieki, kuru vadīja svina pētnieks Rebecca Payne, apšaubīja, vai dažu HLA-B gēnu klātbūtne, kas cieši saistīta ar lēnāku slimības progresēšanu un labāku vīrusu kontroli ir izraisījušas HIV mutācijas, kas varētu efektīvi vājināt tā "vīrusu piemērotību".
Agrāk veiktais pētījums parādīja, ka dažās populācijās bija lielāks indivīdu īpatsvars ar šo reti sastopamo HIV rezistences mutāciju, sākot no 75% Japānā līdz 20% Dienvidāfrikā. Ņemot vērā atšķirības, izmeklētāji sāka domāt, vai tas varētu daļēji veicināt milzīgo epidēmijas atšķirību starp valstīm ar zemu izplatību, piemēram, Japānu un tādiem pārmērīgi izplatītiem reģioniem kā Subsahāras Āfrika.
Tā kā Japānā HIV rādītāji joprojām ir relatīvi zemi, pētnieki koncentrējās savu pētījumu uz pacientu grupu Botsvānā – valstī, kurā HIV epidēmija sasniedza savu maksimumu 2000. gadā, un salīdzināja to ar Dienvidāfrikas saskaņotu kohortu, kas tikai 2010. gadā tas sasniedza maksimumu.
Sākotnējais pētījums atklāja, ka vidējā vīrusu slodze neapstrādātu pacientu vidū Botsvānā, kur slimība ir "vecāka", bija daudz zemāka nekā Dienvidāfrikā, kur slimība ir desmit gadi "jaunāka" (15 350 kopijas / ml attiecīgi 29,350 kopijas / ml). Turklāt, neraugoties uz to, ka CD4 skaits ir mazāks par 50 šūnām / ml nekā Dienvidāfrikā, Botsvānieši ar HIV ilgstošāk dzīvoja, un tas liecina par mazāk virulentu apakštipu.
Izmantojot šos pierādījumus, pētnieki pētīja pacientu HIV ģenētisko struktūru un konstatēja, ka lielākam Botsvānu skaitam bija HLA-B "evakuācijas" mutācija (tas nozīmē, ka vīruss bija pielāgots HLA klātbūtnei) molekula, lai izvairītos no detektēšanas). To darot, zinātnieki uzskatīja, ka vīrusa "fitnesa" potenciāls ir vājinājies, palēninot tā replikācijas spējas, kā arī spēju kaitēt pacienta imūnsistēmai.
Viss teicis, 46% no Botsvānas kohortas bija galvenās HLA-B mutācijas, salīdzinot ar tikai 38% no Dienvidāfrikas.
Testa mēģeņu testi, šķiet, apstiprināja hipotēzi, kad HIV bija Botsvānas paraugs, kas atkārtoja 11% lēnāk nekā Dienvidāfrikā.
Balstoties uz statistikas datiem no pirmsdzemdību aprūpes klīnikām, Payne un viņas komanda arī ierosināja, ka arī Dienvidāfrikā, iespējams, ir samazinājusies HIV virulence, un vidējā vīrusu slodze neapstrādātās sievietes samazinās no 13,550 2002.-2005. Gadā līdz 5750 2012. gadā -2013.
HIV virulences noteikšana Eiropas CASCADE grupā
Eiropas pētījumā bija daudz vienkāršāka, reālākā pieeja, kurā pacientu dati no ilgstošās Eiropas mēroga CASCADE kohorta tika analizēti no 1979. līdz 2002. gadam.
Savā pētījumā CASCADE pētnieki koncentrējās uz diviem galvenajiem faktoriem: vidējais CD4 skaits pēc serokonversijas (kas nosaka, cik dziļi HIV infekcija ir novājinājusi cilvēka imūnsistēmu);
- vidējais vīrusa "noteiktais punkts" (kur vīrusu slodze nokārto pēc akūtas infekcijas stadijas ar lielākām vīrusu slodzēm, kas parasti saistītas ar ātrāku slimības progresēšanu).
- Retrospektīvā analīzē pētnieki atklāja, ka vidējais CD4 skaits samazinājās no 770 šūnām / ml 1979. gadā līdz 570 šūnām / ml 2002. gadā, bet vidējais vīrusu daudzums gandrīz trīskāršojās no 11,200 1979. gadā līdz 31 000 2002. gadā.
Pat vairāk attiecībā uz to, cik lielā mērā šī slimība, no vienas puses, slimniekam, kas ar HIV, šķiet, turpināja attīstīties gadu no gada. Saskaņā ar pētījumu, vidējais laiks, kāds vajadzīgs, lai pacienta CD4 skaits samazinātos zem 350, – ieteicamais antiretrovīrusu terapijas posms – samazinājās no septiņiem gadiem 1979. gadā līdz tikai 3,4 gadiem līdz 2002. gadam.
Galvenās atšķirības pētījumos
Abi pētījumu veidi galu galā ir ierobežoti ar pētījumu plāniem, kas varētu veicināt debates gan zinātnieku, gan politikas veidotāju vidū. Starp galvenajām atšķirībām:
Lai gan Āfrikas pētījumā tika pārskatīti statistikas dati no vairāk nekā 2000 pacientiem Botsvānā un Dienvidāfrikā, faktiskais pacientu skaits, kas iekļauts replikācijas jaudas paraugā, bija ne tikai mazs (16 no Dienvidāfrikas un 63 no Botsvānas), bet tika ņemti vienā brīdī. Savukārt CASCADE grupā tika iekļauti gandrīz 16 000 pacientu, no kuriem visi tika pētīti daudz ilgākā laika periodā.
- Lai gan Payne un viņa komanda koncentrējās uz HLA izraisītu mutāciju ietekmi uz pacienta vīrusa slodzi, viņi nevarēja pierādīt, ka šo mutāciju klātbūtnei bija kāda ietekme uz CD4 izzušanu. Savukārt CASCADE pētnieki uzskatīja, ka CD-4 / vīrusu slodze ir centrāla, lai izveidotu HIV virulenci. Viņi arī ierobežoja iekļaušanu tikai tiem pacientiem, kuri bija diagnosticēti trīs mēnešu laikā pēc inficēšanās, nodrošinot skaidrāku sākuma punktu, lai noteiktu slimības progresēšanu / CD4 noplicināšanos.
- Ir svarīgi atzīmēt, ka CASCADE komanda veica jutīgu analīžu analīzi tikai uz baltiem un gejiem (lai labāk nodrošinātu ārstēšanas vēstures un vīrusu apakšgrupas vienotību). Kaut gan analīze liecināja, ka vīrusu var izlīdzināties visā Eiropā, tā kā kopējā vīrusu slodze samazinās no 31 000 2002.gadā līdz 25,500 2008.gadā, to pašu nevar teikt par gejiem. Tā kā ir zināms, ka HIV strauja izplatīšanās ar geju vīriešu populāciju (kopā ar augstāku ārstēšanas koncentrāciju) ir radījusi lielāku ģenētisko daudzveidību un izdalīto pretestību, iespējams, ka vīrusu apakšgrupa, kas ietekmē šo grupu, faktiski var būt lielāka virulents
- Savukārt Āfrikas pētījums tika veikts tajās valstīs, kur heteroseksuālais sekss bija ne tikai primārais transmisijas veids, bet, ja līdz nesenam laikam HIV infekcijas terapijā bija daudz mazāks indivīdu skaits. Rezultātā tiek uzskatīts, ka HIV ģenētiskā daudzveidība Dienvidāfrikā ir daudz mazāka, un daži pētījumi liecina, ka vīrusa reģionālā mainība var radīt dziļas HIV virulences atšķirības.
- Īsi sakot, neskatoties uz Āfrikas pētījumu trūkumiem un CASCADE pētījumu ierobežojumiem, abi secinājumi varētu būt labi pareizi. Paredzams, ka abas komandas veiks papildu izmeklēšanu.
